O padre e poeta José Tolentino Mendonça (director do Secretariado Nacional da Pastoral da Cultura) considera que a atribuição do Prémio Pessoa 2009 a D. Manuel Clemente distingue "uma das grandes testemunhas do nosso tempo": "D. Manuel Clemente é um dos pensadores mais originais e vivos deste tempo português e alguém que faz do pensamento um exercício de responsabilidade ética". Para Tolentino Mendonça, o magistério do Bispo do Porto "tem sido também um exemplo do que é o diálogo entre a fé e a cultura": "A mim toca-me sempre o modo como a cultura aparece no magistério de D. Manuel Clemente, não como um território de fronteira, que ele visita ocasionalmente, mas como o lugar por excelência onde ele inscreve a tradição cristã e o seu trabalho de pastor".
Tolentino Mendonça disse ainda que este é "um prémio importante, precisamente porque mostra a relevância do pensamento e da acção de D. Manuel Clemente não apenas para o espaço eclesial, mas também para o mundo da cultura. Ele é alguém de que a cultura tem necessidade".
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